Desde Bogotá a San Andrés, el tiempo de vuelo es de aproximadamente 2 a 2 horas y 15 minutos. Operan aerolíneas como Avianca, Latam y Wingo, con vuelos directos disponibles. Bogotá es una de las ciudades con mayor frecuencia de vuelos y suele ofrecer buenas tarifas para este destino. Desde Medellín a San Andrés, el vuelo tiene una duración aproximada de 1 hora y 50 minutos a 2 horas. Generalmente hay vuelos directos, con salidas desde el Aeropuerto José María Córdova en Rionegro. Las aerolíneas que cubren esta ruta son Wingo y Avianca, dependiendo de la temporada. Desde Cali a San Andrés, el tiempo de vuelo es de 2 horas y 30 a 2 horas y 40 minutos. Existen vuelos directos, aunque no todos los días. Avianca y Wingo operan esta ruta según la temporada.